Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Katnb1Q8BG40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Katnb1Q8BG40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms