Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc17a8Q8BFU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc17a8Q8BFU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc17a8Q8BFU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms