Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrfn4Q80XU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrfn4Q80XU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrfn4Q80XU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms