Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdccag8Q80UF4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdccag8Q80UF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms