Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pja2Q80U04 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pja2Q80U04 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms