Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl29Q80T74 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl29Q80T74 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms