Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lca5Q80ST9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lca5Q80ST9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lca5Q80ST9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lca5Q80ST9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms