Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lamp3Q7TST5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lamp3Q7TST5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms