Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpf1Q7TND5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpf1Q7TND5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms