Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc39a4Q78IQ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc39a4Q78IQ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc39a4Q78IQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms