Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sned1Q70E20 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sned1Q70E20 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sned1Q70E20 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms