Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d2bQ6ZWY6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms