Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms