Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ncapd3Q6ZQK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ncapd3Q6ZQK0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Ncapd3Q6ZQK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ncapd3Q6ZQK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms