Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nemp1Q6ZQE4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nemp1Q6ZQE4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms