Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl3Q6W5C0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl3Q6W5C0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cxcl3Q6W5C0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms