Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc57Q6PHN1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc57Q6PHN1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms