Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf4Q6PFF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scaf4Q6PFF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms