Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dhx40Q6PE54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms