Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf1cQ6PDZ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf1cQ6PDZ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf1cQ6PDZ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf1cQ6PDZ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms