Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa4Q6P8K8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cpa4Q6P8K8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa4Q6P8K8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms