Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Asic1Q6NXK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Asic1Q6NXK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Asic1Q6NXK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms