Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frem2Q6NVD0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Frem2Q6NVD0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frem2Q6NVD0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms