Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt77Q6IFZ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt77Q6IFZ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt77Q6IFZ6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Krt77Q6IFZ6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt77Q6IFZ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Krt77Q6IFZ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Krt77Q6IFZ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt77Q6IFZ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms