Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q6DFW0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q6DFW0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6DFW0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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