Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca4Q64444 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca4Q64444 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca4Q64444 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms