Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp1Q62442 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms