Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg1Q62433 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg1Q62433 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg1Q62433 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms