Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpd52Q62393 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpd52Q62393 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms