Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf6Q62311 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms