Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb1i1Q62219 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tgfb1i1Q62219 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tgfb1i1Q62219 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms