Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IbspQ61711 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IbspQ61711 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IbspQ61711 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms