Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsx2Q61412 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsx2Q61412 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms