Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms