Protein–RNA interactions for Protein: Q60870

Reep5, Receptor expression-enhancing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep5Q60870 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Reep5Q60870 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Reep5Q60870 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Reep5Q60870 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms