Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbibQ60778 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfkbibQ60778 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbibQ60778 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfkbibQ60778 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms