Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn11Q60771 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn11Q60771 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms