Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema5bQ60519 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms