Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A1cfQ5YD48 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A1cfQ5YD48 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms