Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc11Q5U458 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc11Q5U458 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc11Q5U458 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms