Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Trim38Q5SZ99 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim38Q5SZ99 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Trim38Q5SZ99 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Trim38Q5SZ99 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim38Q5SZ99 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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