Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mks1Q5SW45 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mks1Q5SW45 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms