Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam71bQ5STT6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam71bQ5STT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms