Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sft2d1Q5SSN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms