Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930512M02RikQ5SQK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930512M02RikQ5SQK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930512M02RikQ5SQK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms