Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsrp1Q5NCR9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nsrp1Q5NCR9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsrp1Q5NCR9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms