Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Trim41Q5NCC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Trim41Q5NCC3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Trim41Q5NCC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms