Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttf2Q5NC05 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms