Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xaf1Q5NBU8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xaf1Q5NBU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xaf1Q5NBU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms