Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ5

Fam189b, Protein FAM189B, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam189bQ5HZJ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam189bQ5HZJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam189bQ5HZJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam189bQ5HZJ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms